Beratung
NGS-Beratung & Assay-Validierung
Die Entwicklung eines zuverlässigen molekularen Assays beginnt mit seinem Verwendungszweck. Ich unterstütze Sie bei Assaydesign, Validierung, Arbeitsabläufen und Interpretation, insbesondere in der molekularen Onkologie.
Assayentwicklung und Einführung
Unterstützung bei gezielter DNA- und RNA-Sequenzierung, Fusionsanalysen und Tumorprofilierung – von der Plattformauswahl bis zur Integration in die Routinepathologie.
- Panel- und Assayauswahl für die diagnostische Fragestellung
- FFPE-Arbeitsabläufe und präanalytische Anforderungen
- DNA- und RNA-Analysen einschließlich RNA-Fusionsanalysen
- Qualitätskontrolle, Fehleranalyse und Ergebnisinterpretation
- Integration molekularer Befunde in die pathologische Befundung
Validierung von NGS-Assays
Ein geeigneter Validierungsplan legt fest, was ein Assay in welchen Proben und unter welchen Qualitätsbedingungen nachweisen soll. Ich kann Ihre Strategie und die zugrunde liegenden Daten prüfen.
- Richtigkeit, Wiederholbarkeit und Reproduzierbarkeit
- Analytische Sensitivität und Planung von Untersuchungen zur Nachweisgrenze
- Variantenklassen, Befundungsbereich und Probenanforderungen
- Aspekte der bioinformatischen Validierung
- Akzeptanzkriterien und Validierungsdokumentation
Liquid Biopsy und MRD
Ich berate auch zu ctDNA- und MRD-Assaykonzepten, etwa zur Nachverfolgung von Mutationen, zur eingesetzten Molekülmenge, zur Sequenziertiefe und zur Interpretation von Angaben zur analytischen Leistungsfähigkeit.
Mögliche Projektergebnisse
Eine Prüfung Ihres Validierungsplans, eine Bewertung analytischer Daten, Empfehlungen für ergänzende Experimente oder praktische Beratung zur Einführung eines neuen molekularen Assays.
Besprechen wir Ihr Projekt.
Beschreiben Sie Ihr Vorhaben und die Unterstützung, die Sie benötigen.